Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN6

DIRC3, Disrupted in renal carcinoma 3, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DIRC3C9JPN6 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DIRC3C9JPN6 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
DIRC3C9JPN6 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
DIRC3C9JPN6 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
DIRC3C9JPN6 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DIRC3C9JPN6 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DIRC3C9JPN6 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms