Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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