Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
HMX2A2RU54 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms