Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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HDGFL3Q9Y3E1 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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HDGFL3Q9Y3E1 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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HDGFL3Q9Y3E1 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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HDGFL3Q9Y3E1 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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HDGFL3Q9Y3E1 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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HDGFL3Q9Y3E1 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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HDGFL3Q9Y3E1 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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HDGFL3Q9Y3E1 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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HDGFL3Q9Y3E1 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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