Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHORDC1Q9UHD1 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms