Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK3Q9UBP4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK3Q9UBP4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK3Q9UBP4 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK3Q9UBP4 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK3Q9UBP4 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK3Q9UBP4 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK3Q9UBP4 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK3Q9UBP4 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK3Q9UBP4 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK3Q9UBP4 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK3Q9UBP4 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK3Q9UBP4 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK3Q9UBP4 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK3Q9UBP4 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK3Q9UBP4 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK3Q9UBP4 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK3Q9UBP4 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK3Q9UBP4 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK3Q9UBP4 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK3Q9UBP4 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK3Q9UBP4 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK3Q9UBP4 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK3Q9UBP4 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK3Q9UBP4 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK3Q9UBP4 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK3Q9UBP4 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK3Q9UBP4 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK3Q9UBP4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK3Q9UBP4 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK3Q9UBP4 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK3Q9UBP4 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK3Q9UBP4 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK3Q9UBP4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK3Q9UBP4 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK3Q9UBP4 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK3Q9UBP4 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK3Q9UBP4 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK3Q9UBP4 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK3Q9UBP4 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK3Q9UBP4 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK3Q9UBP4 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK3Q9UBP4 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK3Q9UBP4 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms