Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CC2D2AQ9P2K1 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CC2D2AQ9P2K1 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CC2D2AQ9P2K1 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CC2D2AQ9P2K1 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CC2D2AQ9P2K1 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CC2D2AQ9P2K1 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CC2D2AQ9P2K1 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CC2D2AQ9P2K1 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CC2D2AQ9P2K1 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CC2D2AQ9P2K1 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CC2D2AQ9P2K1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CC2D2AQ9P2K1 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CC2D2AQ9P2K1 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CC2D2AQ9P2K1 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CC2D2AQ9P2K1 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CC2D2AQ9P2K1 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CC2D2AQ9P2K1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CC2D2AQ9P2K1 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CC2D2AQ9P2K1 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CC2D2AQ9P2K1 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CC2D2AQ9P2K1 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CC2D2AQ9P2K1 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CC2D2AQ9P2K1 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CC2D2AQ9P2K1 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CC2D2AQ9P2K1 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CC2D2AQ9P2K1 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CC2D2AQ9P2K1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CC2D2AQ9P2K1 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CC2D2AQ9P2K1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CC2D2AQ9P2K1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CC2D2AQ9P2K1 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CC2D2AQ9P2K1 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CC2D2AQ9P2K1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CC2D2AQ9P2K1 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CC2D2AQ9P2K1 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CC2D2AQ9P2K1 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CC2D2AQ9P2K1 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CC2D2AQ9P2K1 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CC2D2AQ9P2K1 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CC2D2AQ9P2K1 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CC2D2AQ9P2K1 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CC2D2AQ9P2K1 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms