Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms