Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TBCCD1Q9NVR7 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms