Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TDP1Q9NUW8 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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