Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC6A20Q9NP91 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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