Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM55Q9BYV6 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM55Q9BYV6 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms