Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARD11Q9BXL7 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms