Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SALL3Q9BXA9 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms