Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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RSG1Q9BU20 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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RSG1Q9BU20 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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RSG1Q9BU20 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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RSG1Q9BU20 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RSG1Q9BU20 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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