Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms