Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms