Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS3Q969F9 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS3Q969F9 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS3Q969F9 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS3Q969F9 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS3Q969F9 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS3Q969F9 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS3Q969F9 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS3Q969F9 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS3Q969F9 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS3Q969F9 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS3Q969F9 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS3Q969F9 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS3Q969F9 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS3Q969F9 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS3Q969F9 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS3Q969F9 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS3Q969F9 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS3Q969F9 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS3Q969F9 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS3Q969F9 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS3Q969F9 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS3Q969F9 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS3Q969F9 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPS3Q969F9 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HPS3Q969F9 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms