Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAMP4Q969E2 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms