Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-CQ95604 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms