Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDAQ92838 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDAQ92838 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDAQ92838 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDAQ92838 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDAQ92838 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDAQ92838 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDAQ92838 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDAQ92838 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDAQ92838 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDAQ92838 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDAQ92838 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDAQ92838 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDAQ92838 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDAQ92838 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDAQ92838 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDAQ92838 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDAQ92838 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EDAQ92838 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDAQ92838 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDAQ92838 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EDAQ92838 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDAQ92838 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EDAQ92838 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDAQ92838 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDAQ92838 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDAQ92838 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EDAQ92838 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDAQ92838 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDAQ92838 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDAQ92838 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EDAQ92838 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDAQ92838 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDAQ92838 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDAQ92838 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EDAQ92838 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDAQ92838 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EDAQ92838 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDAQ92838 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDAQ92838 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDAQ92838 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EDAQ92838 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDAQ92838 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDAQ92838 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EDAQ92838 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDAQ92838 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDAQ92838 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDAQ92838 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDAQ92838 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EDAQ92838 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDAQ92838 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDAQ92838 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EDAQ92838 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDAQ92838 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDAQ92838 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDAQ92838 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDAQ92838 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDAQ92838 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EDAQ92838 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDAQ92838 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDAQ92838 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDAQ92838 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EDAQ92838 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDAQ92838 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDAQ92838 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EDAQ92838 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDAQ92838 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDAQ92838 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDAQ92838 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDAQ92838 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDAQ92838 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDAQ92838 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDAQ92838 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDAQ92838 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDAQ92838 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDAQ92838 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDAQ92838 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDAQ92838 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDAQ92838 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EDAQ92838 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EDAQ92838 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EDAQ92838 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EDAQ92838 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EDAQ92838 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EDAQ92838 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EDAQ92838 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EDAQ92838 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EDAQ92838 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDAQ92838 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDAQ92838 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDAQ92838 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDAQ92838 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDAQ92838 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDAQ92838 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDAQ92838 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDAQ92838 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDAQ92838 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDAQ92838 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDAQ92838 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDAQ92838 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms