Protein–RNA interactions for Protein: Q92826

HOXB13, Homeobox protein Hox-B13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB13Q92826 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB13Q92826 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB13Q92826 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB13Q92826 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB13Q92826 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB13Q92826 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB13Q92826 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB13Q92826 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB13Q92826 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB13Q92826 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB13Q92826 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB13Q92826 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB13Q92826 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB13Q92826 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB13Q92826 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB13Q92826 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB13Q92826 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB13Q92826 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB13Q92826 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB13Q92826 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB13Q92826 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB13Q92826 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB13Q92826 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB13Q92826 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB13Q92826 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB13Q92826 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB13Q92826 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB13Q92826 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB13Q92826 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB13Q92826 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB13Q92826 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB13Q92826 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB13Q92826 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB13Q92826 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB13Q92826 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB13Q92826 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB13Q92826 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB13Q92826 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB13Q92826 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXB13Q92826 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB13Q92826 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB13Q92826 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB13Q92826 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB13Q92826 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB13Q92826 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB13Q92826 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB13Q92826 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB13Q92826 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB13Q92826 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB13Q92826 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB13Q92826 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB13Q92826 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB13Q92826 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB13Q92826 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB13Q92826 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB13Q92826 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB13Q92826 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB13Q92826 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB13Q92826 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB13Q92826 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB13Q92826 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB13Q92826 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB13Q92826 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXB13Q92826 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB13Q92826 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB13Q92826 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXB13Q92826 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXB13Q92826 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB13Q92826 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB13Q92826 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB13Q92826 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB13Q92826 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXB13Q92826 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB13Q92826 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB13Q92826 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB13Q92826 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB13Q92826 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB13Q92826 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB13Q92826 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB13Q92826 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB13Q92826 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB13Q92826 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB13Q92826 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB13Q92826 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB13Q92826 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB13Q92826 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB13Q92826 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB13Q92826 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB13Q92826 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB13Q92826 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB13Q92826 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB13Q92826 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB13Q92826 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB13Q92826 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB13Q92826 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB13Q92826 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB13Q92826 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB13Q92826 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB13Q92826 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HOXB13Q92826 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms