Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms