Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM41Q8WV44 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms