Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms