Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD54Q6NXT1 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms