Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms