Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM78BQ5VT40 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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