Protein–RNA interactions for Protein: Q5TG30

ARHGAP40, Rho GTPase-activating protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP40Q5TG30 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARHGAP40Q5TG30 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms