Protein–RNA interactions for Protein: Q5JPI3

C3orf38, Uncharacterized protein C3orf38, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf38Q5JPI3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C3orf38Q5JPI3 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms