Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALFQ53S48 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms