Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL12Q53G59 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms