Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P3H1Q32P28 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms