Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
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