Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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