Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CTF1Q16619 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CTF1Q16619 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CTF1Q16619 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CTF1Q16619 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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CTF1Q16619 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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CTF1Q16619 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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