Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms