Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
VPS72Q15906 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS72Q15906 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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