Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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SCN9AQ15858 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN9AQ15858 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
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