Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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