Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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CHD4Q14839 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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CHD4Q14839 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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CHD4Q14839 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHD4Q14839 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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