Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms