Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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CDH18Q13634 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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CDH18Q13634 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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CDH18Q13634 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDH18Q13634 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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