Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNW1Q13573 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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