Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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SGCGQ13326 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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SGCGQ13326 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
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SGCGQ13326 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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SGCGQ13326 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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