Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF6Q13247 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRSF6Q13247 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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