Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMAN2Q12907 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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