Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms