Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK18Q07002 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms