Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms